11/5/2020

Covid-19: una nuova strategia per la ricerca di articoli in PubMed

www.pubmed.ncbi.nlm.nih.gov
In una nostra news di marzo Nuovo coronavirus Covid-19: come restare al passo con gli aggiornamenti? Consigli per la ricerca in PubMed, elaborata nelle fasi iniziali dell’epidemia, ci eravamo già posti il problema di come aiutare i non esperti a elaborare una strategia di ricerca efficace in Pubmed.

Sebbene infatti, Pubmed inserisca le citazioni non in modo automatico e immediato, rimane però sicuramente una fonte attendibile e più veloce rispetto alla consultazione dei singoli siti degli editori.

La vecchia stringa proposta:
(wuhan[All Fields] OR china) AND ("coronavirus"[MeSH Terms] OR "coronavirus"[All Fields]) OR "novel coronavirus"[All Fields] OR nCoV[All Fields] OR "covid-19"[All Fields] OR "SARS-CoV2"[All Fields]

Ne proponiamo ora una nuova, che NON comprende i termini: "(wuhan[All Fields] OR china).

Inizialmente i termini (wuhan[All Fields] OR china) erano stati inseriti per limitare i risultati, ma l’epidemia Covid-19 iniziata in Cina è ora pandemia e gli studi pubblicati non sempre riportano questi riferimenti.

Utilizzando la vecchia stringa “perdiamo” studi comeCoronavirus disease 2019 infection and the cardiovascular system”, che non contiene riferimenti a Wuhan o China.

Scegliamo la “sensibilità” più che la “specificità”!

La nuova stringa proposta è:

"coronavirus"[MeSH Terms] OR "coronavirus"[All Fields] OR "COVID-19"[Supplementary Concept] OR "severe acute respiratory syndrome coronavirus 2"[Supplementary Concept] OR COVID[All Fields] OR "covid-19"[All Fields] OR "covid19"[All Fields] OR "novel coronavirus"[All Fields] OR nCoV[All Fields] OR "SARS-CoV2"[All Fields]

link diretto: bit.ly/covid-19-pubmed


Abbiamo scelto di utilizzare soprattutto termini generici, ma PubMed ha predisposto e sta implementando nuovi MESH Term.

Ne riportiamo alcuni come esempio, evidenziando che, data la quantità di studi inseriti ogni giorno nel portale, molti articoli non sono ancora indicizzati.

publication dateAttenzione!
Rimane sempre il problema dei vecchi studi che vengono identificati: per esempio studi sulla SARS che nel 2002 era un “novel coronavirus”!
Avevamo già suggerito come risolvere, aggiungendo un limite alla ricerca.
Nella vecchia versione di PubMed era possibile indicare una data precisa, mentre nuovo pubmed possiamo impostare la data (vedi a fianco come fare)